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Jul

5

量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3,3/3

awsを中心としたクラウドシステムとhtmlインターフェイスで実際のアプリを作ります。

Organizing : MDR株式会社

Registration info

参加枠1

Free

FCFS
12/70

Description

はじめに

量子アニーリングを使用した社会実装が望まれていますが、実際にどのようにアプリケーションに仕立て上げるのかが難しいところですが、弊社のノウハウを活用したクラウドサービスと量子コンピュータをつなげる方法を勉強会方式で3回に分けて考察・実装して行きたいとおもいます。予定が詰まってて終わらんので7月になってしまいました。

アプリケーションについて

創薬への応用を前提にタンパク質折りたたみ問題の実装をして見ます。

計算マシンについて

弊社契約のD-Wave社の実機をつかったものを活用したいと思います。 https://www.dwavesys.com/press-releases/mdr-corporation-and-d-wave-systems-announce-quantum-computing-agreement

フロントアプリケーションについて

フロントエンドはhtml/css/javascript(jquery)をベースにデザインはbootstrap ajaxで計算サーバーとやりとりしながら問題に対してエネルギーの安定状態を求めます。

折りたたみについて

折りたたむ方向によってイジングを対応させます。

多体問題の分解について

厄介ですが、これもすでにD-Waveで解いて見ました。こちらを活用します。 https://qiita.com/YuichiroMinato/items/c88d920141abfb2e556c

前処理

前処理関連は既存計算機でやります。

最適化計算

代替ルートからの提案はキメラグラフをベースにQUBOベースのハミルトニアン立式。 接続数やデータ数が多い場合にはqbsolvを活用したいですが、当初シミュレータの場合には、 問題分割を行わないで行うかもしれません。こちらは勉強会を進めながら意見を聞いて進めたいです。

システム

基本的にはawsのs3/ec2/lambdaなどのクラウドインターフェイスを活用します。

データ

データは簡単なモデルでやって見ます。

数式変形

途中で面倒な変形が出ますので、そのあたりをどうするかを考察します。

勉強会オンラインコミュニティ

随時情報の更新や勉強会の資料が手に入ります。わからないところを質問したり、ニュースの交換があります。
下記招待コードよりぜひご参加ください。

https://join.slack.com/t/mdr-qc/shared_invite/enQtMzgxNDI3MTAyNzA3LThmYmRhZjkwYzFiZjRjNWZkNzJhOWMwOWNiYzgxYjdkNWE4ODA5ZWExZGYwZjFjM2RmNjE2ODJlYjgyNzNkNjY

場所

本郷三丁目を予定しています。

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Feed

Yuichiro Minato

Yuichiro Minato published 量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3,3/3.

06/14/2018 12:24

(コピー)量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 を公開しました!

Group

量子コンピュータ

アプリケーションを中心に学びます。

Number of events 590

Members 2871

Ended

2018/07/05(Thu)

16:30
17:30

You cannot RSVP if you are already participating in another event at the same date.

Registration Period
2018/06/14(Thu) 12:12 〜
2018/07/05(Thu) 17:30

Location

Blueqat Hub/ MDR株式会社

東京都文京区本郷2丁目40-14山崎ビル3F

Organizer

Attendees(12)

ooohiroyukiooo

ooohiroyukiooo

量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 に参加を申し込みました!

efuji001

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 に参加を申し込みました!

yyanagihara1213

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3に参加を申し込みました!

mitz

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3に参加を申し込みました!

sonicmove

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 に参加を申し込みました!

prototechno

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 に参加を申し込みました!

KanSAKAMOTO

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3 に参加を申し込みました!

Autoalge

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量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3に参加を申し込みました!

yun

yun

量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3に参加を申し込みました!

hm2016

hm2016

量子アニーリングを使ったタンパク質折りたたみアプリケーションの実装その2/3,3/3 に参加を申し込みました!

Attendees (12)

Canceled (4)